投资 / 投资简报
Cyanea
让生物信息学分析始终保持版本化、随时可以运行,无论是在浏览器中,还是在机构自己掌控的服务器上,数据都不必移动。
大多数已发表的生物学 notebook 已经无法再运行:一项研究考察了一万多个 notebook,能重新得出相同结果的不到十分之一。Cyanea 把每一项分析与其确切的数据和版本一起保存,并在浏览器中通过 WebAssembly 运行,或在机构自己掌控的节点上运行,因此敏感数据不必离开原地。它是开源的,构建在 18 个经过测试的 Rust 库之上,目前处于公开 alpha 阶段。
问题
分析活不过它的作者。依赖会漂移,数据链接会失效,没有人说得清某张图是由哪个文件的哪个版本生成的。学生一离开,工作也随之离开。
- 学术实验室 一位课题负责人带着几名学员,审稿人要求可复现性,而每逢有人毕业,结果就会消失。
- 核心设施 它们为许多客户实验室提供分析,需要能够移交并经得起质询的版本化结果。
- 生物技术团队 5 到 20 人的小型计算团队,需要标准化分析、审计追踪和快速上手。这是第一批付费买家。
- 联盟与制药企业 多个站点需要共享方法,却不能移动患者数据或专有数据。
- 教学 无需安装的 notebook 和一套学习课程:这是漏斗的顶端。
产品
- Spaces 数据集、notebook、实验方案和结果一起进行版本管理,支持单元格级别的差异比较和恢复。
- 锁定的输入 每个数据文件都按其 SHA-256 哈希存储,结果会链接回生成它们的单元格、代码版本和数据。
- 在浏览器中运行 notebook 单元格在 worker 中通过 WebAssembly 运行,无需安装任何东西。六个浏览器工具可以查看序列、比对、FASTQ、VCF 和进化树,文件始终不离开本机。
- Rust 分析核心 18 个采用 Apache 许可证的 crate,约 3,700 个测试,覆盖从序列和比对到单细胞、系统发育学和蛋白质组学的领域。
- 内置 21 种格式 从 FASTA 和 FASTQ 到 VCF、BAM、Parquet、PDB 和 Newick,上传时即可识别并建立索引。
- 为团队而建 组织和角色、实时在线状态、带 webhook 的 REST API、Jupyter 导入,以及 ORCID 登录。
联邦功能让自托管节点能够以内容哈希清单的形式相互发布选定的 space,这样方法可以流动,而数据留在原地。
市场
各家市场报告对生物信息学的定义不同,这些数字仅作背景参考。单独针对科学 notebook 的可靠数字并不存在,本页也不会凭空编造一个。
- 235 亿美元 2025 年全球生物信息学市场规模,每年增长 13%,到 2030 年达到 435 亿美元。BCC Research
- 80 亿美元 2025 年计算生物学市场规模,预计到 2034 年达到 227 亿美元。Global Market Insights
- 42 亿美元 2025 年生物信息学服务市场规模,每年增长 16%。Persistence Market Research
为什么是现在
- 8.5 % 生物医学论文中能复现出相同结果的 notebook 比例:10,388 个中的 879 个。GigaScience 2024
- 70 %+ 曾经未能复现其他科学家实验的研究人员比例。Nature 调查
- 2025/327 欧盟健康数据法规要求二次使用必须在安全处理环境中进行;瑞士法律将遗传数据视为敏感数据。分析必须走向数据。Belgian Health Data Agency
- 800+ 巴塞尔地区的生命科学公司数量,就在 Cyanea 的家门口。BaselArea
WebAssembly 如今能在浏览器中以接近原生的速度运行 Rust:Cyanea 的 FASTA 解析器每秒读取约 2.4 GB,大约是 BioPython 的六倍,结果精确到每一位数字都完全相同。而随着 AI 让分析代码变得廉价,稀缺的资产变成了一份可信的记录:什么代码在什么数据上运行过。
与众不同之处
- 在你所在的地方运行 分析可以在浏览器中运行,无需安装任何东西,也可以在机构自己掌控的服务器上运行。
- 每个输入都被锁定 内容寻址的数据和版本化的 notebook,让每个结果都准确指向生成它的东西。
- 共享方法,而非数据 自托管节点相互发布选定的 space;患者数据留在原地。
- 同一个经过验证的核心随处运行 同样的 Rust crate 在服务器、浏览器和 Python 中运行,并以 BioPython 为基准进行验证。
- 默认开放 节点和库都采用 Apache 2.0 许可证,自托管节点没有套餐限制。
竞争
| 公司 | 他们做什么 | Cyanea 的不同之处 |
|---|---|---|
| Galaxy | 面向工具工作流的开放 Web 平台,在服务器上运行 | 代码 notebook 和版本化数据在同一个 space 中,支持浏览器执行和联邦 |
| Jupyter, Google Colab | 通用 notebook;Colab 在 Google 的服务器上运行 | 数据和版本随 notebook 一起流动,无需上传给第三方 |
| marimo, Observable, Deepnote | 响应式或托管的通用 notebook | 原生面向生物信息学,内置 Rust 库和 21 种格式 |
| Posit | R 和 Python IDE 以及企业服务器 | 无需安装;溯源和数据版本管理是核心对象 |
| Seqera (Nextflow) | 在 HPC 和云上编排流水线 | Cyanea 保存交互式分析的记录,并被设计为可以接收流水线结果 |
| DNAnexus, Terra | 托管你数据的云端基因组学平台 | 数据可以留在机构自己的节点上 |
| Code Ocean | 用于可复现论文的容器化胶囊 | 更轻量:浏览器执行、无需容器、联邦式共享 |
| Latch Bio | 面向生物技术的托管工作流和无代码界面 | 开源、可自托管、本地优先 |
商业模式
开放核心模式:自托管免费,托管中心对自托管无法替代的部分收费。计费和套餐限制已经实现。
- 0 美元 免费版:公开 space、浏览器执行和 1 GB 存储。
- 98 美元 专业版,每用户每月:私有 space、100 GB 存储和服务器算力额度。
- 499 美元 团队版,每个工作区每月:1 TB 存储、五个席位和审计导出。
- 15,000+ 美元 企业版,每年:本地部署或物理隔离部署,以及支持服务。
市场进入从三到五个设计合作伙伴开始:两个学术实验室和一个生物技术团队,每家带来一项真实的分析,以换取反馈的方式免费使用一年专业版或团队版。核心设施,以及把数据驻留视为硬性规定的瑞士和欧盟团队,是天然的第一批买家。
目前进展
- 公开 alpha 托管中心和网站已在 cyanea.bio 上线。
- 3,700 18 个开源 Rust crate 中的测试数量,这些 crate 已发布在 crates.io 上。
- 10 预置的入门 space,每个领域一个,另有六个浏览器工具。
目前还没有付费客户,也还没有设计合作伙伴。Python 和 R 单元格可以被接收,但还不能运行;自托管节点仍然依赖一个将会开源的核心库。这些是资金最先投入的地方。
风险
- “浏览器里的玩具” 生物学家使用 Python 和 R 工作。Python 执行和 GB 级服务器算力是第一优先级;服务器路径已经存在。
- 自托管依赖一个私有核心 开源核心库已列入计划,会在第一笔企业销售之前完成。
- 联邦信任 清单目前采用内容哈希;下一步是加密签名。
- 开源与收入 托管中心对托管算力、网络、治理和支持收费,这些是自托管无法替代的。
- 一位创始人,范围很广 战略有意收窄广度,以可复现分析为先导,而不是以 crate 的数量为先导。
- 合规型买家 受监管的客户需要 SOC 2 或 HIPAA。已计划在企业阶段完成。
资金将用于什么
- 第 0 到 3 个月 支持一键重新运行和差异比较的运行记录、溯源图、在浏览器和服务器上运行 Python,以及三到五个设计合作伙伴。
- 第 3 到 6 个月 GB 级服务器算力、审阅与批准、审计导出、Nextflow 和 Snakemake 导入,以及第一批付费团队。
- 第 6 到 9 个月 跨两个节点的联邦式重新运行、签名清单、SSO、通往 SOC 2 的路径,以及开源的核心库。